Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms