Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med21Q9CQ39 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med21Q9CQ39 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med21Q9CQ39 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med21Q9CQ39 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med21Q9CQ39 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med21Q9CQ39 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med21Q9CQ39 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med21Q9CQ39 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med21Q9CQ39 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med21Q9CQ39 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med21Q9CQ39 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms