Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp3Q9CQ10 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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