Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt88Q9CPR6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt88Q9CPR6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms