Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim26Q99PN3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms