Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2a1Q99PM3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gtf2a1Q99PM3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.7 ms