Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms