Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms