Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ms4a6bQ99N09 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms