Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms