Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gins4Q99LZ3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms