Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms