Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms