Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5lQ99LH9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5lQ99LH9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5lQ99LH9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5lQ99LH9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp5lQ99LH9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp5lQ99LH9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp5lQ99LH9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5lQ99LH9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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