Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp16Q99LG0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms