Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DhddsQ99KU1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms