Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clint1Q99KN9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clint1Q99KN9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms