Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emc3Q99KI3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms