Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krcc1Q99JT5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krcc1Q99JT5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms