Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GatbQ99JT1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GatbQ99JT1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms