Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip2Q99JG7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms