Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pacsin3Q99JB8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pacsin3Q99JB8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms