Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cldn16Q925N4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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