Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Letmd1Q924L1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Letmd1Q924L1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.4 ms