Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrif1Q923B3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms