Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb6Q922F4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms