Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Afg3l1Q920A7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Afg3l1Q920A7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms