Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WD4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WD4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WD4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WD4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WD4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WD4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WD4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WD4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WD4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WD4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WD4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WD4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q91WD4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WD4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WD4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WD4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WD4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WD4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WD4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WD4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WD4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WD4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WD4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WD4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q91WD4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WD4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WD4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WD4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WD4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WD4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WD4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WD4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WD4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WD4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WD4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WD4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q91WD4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WD4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WD4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WD4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WD4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WD4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WD4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WD4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WD4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WD4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WD4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q91WD4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q91WD4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Q91WD4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q91WD4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q91WD4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q91WD4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q91WD4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q91WD4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q91WD4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q91WD4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q91WD4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q91WD4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q91WD4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q91WD4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q91WD4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q91WD4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q91WD4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q91WD4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q91WD4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q91WD4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q91WD4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q91WD4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q91WD4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q91WD4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q91WD4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q91WD4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms