Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsl6Q91WC3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acsl6Q91WC3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms