Protein–RNA interactions for Protein: Q91WB7

Ubtd1, Ubiquitin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd1Q91WB7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubtd1Q91WB7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubtd1Q91WB7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms