Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIL2

Rwdd3, RWD domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd3Q8VIL2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd3Q8VIL2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd3Q8VIL2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms