Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crb1Q8VHS2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crb1Q8VHS2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms