Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppargc1bQ8VHJ7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms