Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc115Q8VE99 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms