Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf4Q8VE97 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf4Q8VE97 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms