Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slf1Q8R3P9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slf1Q8R3P9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms