Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2f2Q8R0A0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms