Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Colec12Q8K4Q8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Colec12Q8K4Q8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Colec12Q8K4Q8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Colec12Q8K4Q8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Colec12Q8K4Q8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.7 ms