Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms