Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Scara5Q8K299 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scara5Q8K299 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms