Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms