Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit1Q8K099 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit1Q8K099 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms