Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms