Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CopaQ8CIE6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CopaQ8CIE6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms