Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aldh4a1Q8CHT0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh4a1Q8CHT0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms