Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ercc8Q8CFD5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ercc8Q8CFD5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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