Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx8Q8CFD4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx8Q8CFD4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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