Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
E4f1Q8CCE9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E4f1Q8CCE9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms