Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ephb1Q8CBF3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ephb1Q8CBF3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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