Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Lrrn3Q8CBC6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrrn3Q8CBC6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrrn3Q8CBC6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrrn3Q8CBC6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrrn3Q8CBC6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrrn3Q8CBC6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrrn3Q8CBC6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrrn3Q8CBC6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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